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ラボでやろう。

分子模型は直観的に構造を理解することに有用です。複雑な構造を持ったタンパク質の分子模型を手軽に印刷し、研究に役立てる日が来ることを目指してブログを開始しました。※2013年9月現在、ほぼその製法を確立出来つつあります。もし自分の研究室でも、と考えていらっしゃる方は、まず川上までご連絡ください。

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備忘録代わりに。

 そういえば以前chimeraしかSTL吐き出しに対応していないと言いましたが、PymolやmolmolでVRML2(拡張子.wrl)のデータを出力後、無料ソフトを用いてSTLに変換できる事が分かりましたので書いておきます。MeshLabでvrmlをひらき、[export mesh as]メニューでstlに変換できます。
 また、データを分割したいときには、netfabbというソフトが使えます。あらかじめ割りたい方向に分子を向けてからSTLに保存しておき、これをnetfabbで開きます。x,y,z軸に沿って任意の高さの断面で分割できるので、分割後、それぞれのパーツをSTLで保存できます。これで分子表面のデータも、上下分割して印刷してオーバーハング部分を極力減らし、つるっとした分割面同士を後で貼り合わせれば、綺麗な分子表面模型が出来あがります。
  1. 2013/02/21(木) 18:01:59|
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