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ラボでやろう。

分子模型は直観的に構造を理解することに有用です。複雑な構造を持ったタンパク質の分子模型を手軽に印刷し、研究に役立てる日が来ることを目指してブログを開始しました。※2013年9月現在、ほぼその製法を確立出来つつあります。もし自分の研究室でも、と考えていらっしゃる方は、まず川上までご連絡ください。

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現在までの状況その3

やわらか模型の場合、カラフルな模型を打ち出すため、データはカラーを持ったまま加工する必要が
あったため、VRML2というフォーマットで編集をしていました。
それ以外のフォーマットでファイル保存をすると、カラー情報を失ってしまうのです。
PyMol,Chimera,molmolがそれに対応していました。

今度の場合、Cube付属のソフトが認識できるフォーマットはSTLです。
残念ながら、Chimeraしか対応していません。(molmolは未確認)
PyMolでvrmlで吐き出したのち、変換ソフトでSTLにするという方法も
あると思いますが、やはり簡便さを優先すると、使用するPDBソフトはChimera一択になります。

また、RP-RasMolというのもあるようです。これは3D印刷用に特化した
RasMolのようですが、今回のCubeのような印刷方法のプリンタに有用かどうかは
わかりません。また特別に彼らとコンタクトを取らないと入手できなさそうです。

さてSTLのデータをさっそく作成しましょう。



  1. 2012/09/14(金) 23:17:07|
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