ポリゴンエラーについて。

さて、３Ｄプリンタを買いました。ここに書かれているようにして３Ｄデータを作りました。
印刷しようと３Ｄプリンタのドライバソフトに読み込んでみたら…
UP!の場合、ポリゴンエラー（赤く表示）が出ませんでしたか？
Cubeの場合は特に何も出ません。しかし、マニュアルにはHealボタンを押すことを推奨されているでしょう。
Ｌｏａｄボタンの横にデンと、Ｈｅａｌボタンがありますよね。

たいていの場合、pdbviewerで出力したstlやvrml（meshlabなどでstlに変換）は、そのままでは
印刷に適さないのです。

ええっと驚かれるかもしれませんが、これは、分子ビューワーが、特段３Ｄプリンターでの使用を前提とした、３Ｄデータの出力を想定していないからです。

どういうことかというと、ボール＆スティック表示を考えましょう。
ビューワは、その言葉の通り、ボール状のオブジェクトと、スティック状（細長い円柱）のオブジェクトを発生させて描画しています。３Ｄデータの吐き出し時も、このまま、ボールと、スティックを出力します。
ボールとスティックの接点はどうなっているでしょうか。ボールの中にスティックが突き刺さっていませんか？
二つのオブジェクトが重なっています。
別のビューワでは、ひょっとしたらスティック部分は、円柱ではなくて、ただの円筒で表示されているかもしれません。そのまま出力するとどうなるでしょう。厚みゼロの円筒がボールに突き刺さっています。
ボールに完全に突き刺さっているなら、まだ救いが有ります。これが中途半端に刺さっていた場合、円筒の刺さりきれなかった部分に、円筒の内部が見えてしまうような隙間が出来たとします。
こうなると大変です。厚みゼロの円筒オブジェクト、これは３Ｄプリンタでは再現できない形状です。
先ほどの円柱とボールが重なって刺さっている場合も、エラーとして認識される場合が多いです。単にオブジェクトを重ねているだけでは、それは造形可能な３Ｄ物体として認識されないことが多いのです。

リボンモデルの場合、良くできたビューワはβストランドの終わり部分と、続くループ部分のつなぎ目を、うまく処理して描画し、また３Ｄデータも出力してくれます。あるビューワはそこで不連続な部分が見つかることがあります。急に曲がる角度のついた構造で頻発する場合もあります。

このように、現在のビューワには、３Ｄデータとしての完成度を考えずに、単に「見えていればいいよね」というＣＧの概念に沿った描画法のものしかありません（仕方ありません、当時は３Ｄプリンタの使用を想定していないのですから）。

現在執筆中の本にも書きましたが、今後、３Ｄプリンタでの印刷を想定した描画形式、３Ｄデータ出力形式のビューワが開発されるべきです。そうなると、今書いている内容はもう意識をする必要なくなります。

長々と書きましたが、たいていの場合そのまま印刷は出来ませんよ、というのを頭に入れておいてください。

ではどうするか、は次回に。